رایج ترین کاربرد آزمایش مدفوع ،تشخیص انواع مختلف انگلهای بیماری زا در روده است.بهتر است این آزمایش در 3 نوبت انجام شود.

1.نمونه یک یا2 ساعت قبل از انتقال به آزمایشگاه می ‌ تواند تهیه شود.

2.نمونه بایدمستقیما در ظرفی که از طرف آزمایشگاه در اختیار شما قرار می گیرد،جمع آوری شود.

3.در موردبیماران بستری، نمونه را در یک ظرف خشک جمع آوری نموده و به ظرف مخصوص برچسب دار منتقل نمایید.از بخش بلغمی یا خونی مدفوع درون ظرف مخصوص ریخته شود.

4.در صورت مشاهده کرم و هر مورد مشکوک آن را در ظرف قرار داده و به آزمایشگاه اطلاع دهید.

5.نمونه جمع آوری شده را خصوصا در موارد مشکوک به اسهال خونی بلافاصله به آزمایشگاه تحویل دهید.

6  .نمونه مدفوع نباید با ادرار یا آب آلوده شود.