در سال 1384 در دانشکده علوم پزشکی خراسان شمالی ، دو رشته بهداشت مبارزه با بیماری ها و بهداشت خانواده با تعداد 40دانشجو راه اندازی گردید.سپس همزمان با ارتقاء دانشکده علوم پزشکي خراسان شمالي به دانشگاه علوم پزشکي، بر اساس مصوبه يک صد و هشتاد و ششمين جلسه شوراي گسترش دانشگاه هاي علوم پزشکي با ايجاد دانشکده بهداشت موافقت شد و اين دانشکده در سال 1387 راه اندازي شد .

 در حال حاضر دانشکده بهداشت در 4 رشته کارشناسي بهداشت عمومي، بهداشت محیط و بهداشت حرفه ای  و تغذیه در مقطع پیوسته و ناپیوسته دانشجو مي پذيرد. همچنین دررشته کارشناسی ارشد آموزش بهداشت و ارتقاء سلامت به صورت مشترک با دانشگاه علوم پزشکی سبزوار پذیرش دانشجو انجام میگیرد.  

تعداد دانشجویان مشغول به تحصیل در حال حاضر در دانشکده  460 نفر می باشد. افتتاح ساختمان جدید دانشکده بهداشت توسط مقام عالی وزارت جناب آقای دکتر قاضی زاده هاشمی در سال 1393 در زمینی به مساحت 10000 مترمربع و زیربنای 2200 مترمربع ، مجهز به آزمایشگاه، کتابخانه، سایت آموزشی و پژوهشی، سالن اجتماعات وکنفرانس و... واقع در پردیس دانشگاه صورت پذیرفت.