بعد از تقسيم استان خراسان بزرگ به سه استان و تاسيس استان خراسان شمالي ، سرپرستی دانشكده پرستاری و مامایی و بهداشت و درمان استان در مورخه 1384/1/21 با ابلاغ مقام محترم وزارت وقت به دکتر «محمدعلی سلطانی» سپرده شد . 
پس از آن در مورخه 1384/6/28 موافقت قطعی وزارت متبوع با تاسیس دانشکده علوم پزشکی استان اعلام و دكتر «جواد شاهين فر» به سرپرستی دانشکده منصوب گردید. 
در سال 87 موافقت قطعی تاسیس آموزشکده بهداشت و موافقت اصولی تاسیس دانشکده پزشکی استان اعلام شد، با آموزشی شدن بیمارستان های امام علی (ع) و امام رضا (ع) بجنورد موافقت گردید و سرانجام موافقت قطعی ارتقای دانشکده علوم پزشکی به دانشگاه نیز در همین سال اعلام شد. 
 در مورخه 1387/2/21 با تصويب شوراي گسترش دانشگاه هاي علوم پزشكي كشور، دانشكده استان به دانشگاه علوم پزشكي و خدمات بهداشتي درماني خراسان شمالي تغيير عنوان يافت و همچنان دکتر «جواد شاهین‌فر» به عنوان نخستین رئیس دانشگاه علوم پزشکی خراسان شمالی سکان مدیریت این مجموعه نوپا را بر عهده‌ داشت