آزمایشگاه دارای بخش های پاتولوژی و کلیه ی بخش های تشخیصی، طبی، بالینی از جمله بیوشیمی، هماتولوژی، هورمون شناسی، میکروب شناسی، تجزیه ی ادرار، انگل شناسی، سرولوژی و بانک خون می باشد.

بخش بیوشیمی:

شامل دستگاه اتوآنالایزر بیوشیمیPrestige  و الکترولیت آنالایزر ژوکو و دستگاه آنالیز گازهای خونی (َ Medica(ABGجهت انجام کلیه ی آزمایشات بیوشیمی ، سدیم/پتاسیم و ... است.

بخش میکروب شناسی:

که در دو بخش عمومی و تخصصی فعالیت دارد و در تشخیص بیماری های عفونی ادراری،تنفسی و ... نقش بسزایی دارد.هم چنین  به بخش کنترل عفونت بیمارستان در جهت ایجاد محیط عاری از میکروب کمک می نماید.

بخش هماتولوژی(خون شناسی):

با در اختیار داشتن دستگاه هایی چون 2 عدد Sysmex KX21-N ، سدیمان ریدر Lena و نایکوکارد در تشخیص بیماری های خونی  و فرآورده های آن به پزشکان محترم کمک می نماید.

بخش هورمون شناسی:

 با در اختیار داشتن دستگاه های پلیت ریدر و الایزا واشر و انجام آزمایش هایی چون:

PSA،فریتین،ßHCG،گروه هپاتیت(Hbs Ab,Hbs ag ..) آزمایشات تیروییدی(T3, T4 و TSH) در تشخیص این بیماری ها که اغلب بی علامت هستند تاثیر گذار است.

بخش بانک خون:

این بخش به طور شبانه روزی با سازمان انتقال خون در ارتباط است و ضمن مدیریت و کنترل فرآورده های خونی و اجرای استاندارد های سازمان انتقال خون ،در فراهم نمودن خون و فرآورده های آن شامل:FFP ، پلاکت ،کرایو و ... با سازمان همکاری دارد تا فرآورده ها در کمترین زمان ممکن برای بیماران تهیه شده و مورد استفاده قرار بگیرد.

بخش سرولوژی:

در تشخیص بیماری های عفونی و شایع (تب مالت،حصبه...) بیماری های آرتریت روماتویید و مفصلی کمک می نماید.